ننشر أماكن المدارس المصرية اليابانية على مستوى جمهورية مصر العربية، وهي 28 مدرسة، في القاهرة مدرسة واحدة بالشروق (1)، وفي مرسى مطروح المدرسة المصرية اليابانية بالحمام، وفي البحيرة يوجد مدرسة واحدة بالنوبارية، في السويس يوجد مدرسة واحدة وهي المدرسة المصرية اليابانية بفيصل، أما في الإسماعيلية يوجد مدرسة واحدة وهي المدرسة المصرية اليابانية بالإسماعيلية، أما في جنوب سيناء يوجد مدرسة واحدة بطور سيناء.
وفي محافظة الدقهلية يوجد 3 مدارس وهم (المدرسة المصرية اليابانية بجمصة، المدرسة المصرية اليابانية بتمي الأمديد، المدرسة المصرية اليابانية بميت غمر) وفي محافظة الجيزة يوجد 3 مدارس أيضا في (حدائق أكتوبر، المدينة الصناعية بأكتوبر، والشيخ زايد)، أما في محافظة القليوبية يوجد مدرسة واحدة في العبور.
وفي بني سويف يوجد مدرسة واحدة في بني سويف الجديدة، أما في البحر الأحمر يوجد مدرسة واحدة بالغردقة (1)، وفي كفر الشيخ يوجد مدرسة واحدة ببيلا، أما في أسيوط يوجد مدرسة واحدة بأسيوط الجديدة، وفي الشرقية يوجد 3 مدارس في المناطق التالية (كفر صقر، العاشر من رمضان (1)، العاشر من رمضان (2).
وشملت القائمة مدرسة واحدة في محافظة بورسعيد داخل حي العرب، وفي المنوفية يوجد مدرستين واحدة بشبين الكوم والثانية بقويسنا، وفي دمياط يوجد مدرسة واحدة في دمياط الجديدة، وفي الفيوم مدرسة واحدة في منطقة الفيوم الجديدة، أما في الغربية يوجد مدرستين واحدة في طنطا والأخرى في الشهيد كريم رفعت أحمد، وأخيرا في أسوان يوجد مدرسة واحدة وهي المصرية اليابانية بالرديسية.